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應(yīng)用案例
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天木生物MMC成功助力高產(chǎn)酪氨酸大腸桿菌的選育

來源:   作者: 發(fā)布日期:2024-03-06 訪問量:2513

? ? ? 本期為您推薦江南大學(xué)未來食品科學(xué)中心副主任周景文教授團(tuán)隊(duì)發(fā)表在Synthetic and Systems Biotechnology上面的一篇文章Synergetic engineering of Escherichia coli?for efficient production of L-tyrosine本研究通過協(xié)同工程策略,針對(duì)莽草酸途徑并微調(diào)代謝過程,并利用實(shí)驗(yàn)室適應(yīng)性進(jìn)化(MMC)提高菌株對(duì)酸性條件的耐受性,最終獲得了一株優(yōu)化的菌株,在5升發(fā)酵罐中62小時(shí)內(nèi)能夠產(chǎn)生92.5 g/LL-酪氨酸,對(duì)L-酪氨酸的工業(yè)化生產(chǎn)有著重要的意義。

? ? ??L-酪氨酸在食品、飼料、化工和制藥行業(yè)中具有廣泛的應(yīng)用,它不僅是多種天然產(chǎn)物的前體,如咖啡酸、類黃酮和姜黃素等,還涉及治療帕金森綜合癥的藥物L-DOPA的合成。盡管L-酪氨酸具有重要的工業(yè)價(jià)值,傳統(tǒng)化學(xué)合成或者酶促法生產(chǎn)酪氨酸的工藝存在成本高和穩(wěn)定性差的缺點(diǎn)。微生物發(fā)酵法產(chǎn)酪氨酸具有成本低,操作簡(jiǎn)單等優(yōu)勢(shì),但是也存在產(chǎn)量較低,高密度發(fā)酵菌株不夠穩(wěn)定等缺點(diǎn)。

? ? ??研究人員以大腸桿菌WSH-Z06作為起始菌株,對(duì)莽草酸和芳香氨基酸積累相關(guān)的幾個(gè)基因進(jìn)行過表達(dá)和敲除混合驗(yàn)證,得到一株聯(lián)合4個(gè)基因過表達(dá)與3個(gè)基因敲除的菌株,48 h搖瓶L-酪氨酸產(chǎn)量達(dá)到4.22 g/L(圖2 )。接著在其莽草酸途徑中添加磷酸解酮酶途徑(PK),發(fā)現(xiàn)菌株在搖瓶中的OD600提升了9.8%,但是整體的L-酪氨酸產(chǎn)量呈現(xiàn)降低趨勢(shì)。整合2個(gè)NADHNADPH互相轉(zhuǎn)化的基因后,得到的菌株產(chǎn)量提升至6.17g/L(圖3a)。將該菌株進(jìn)行5L發(fā)酵罐水平的發(fā)酵,L-酪氨酸的產(chǎn)量達(dá)到50.2 g/L,同時(shí)在發(fā)酵液中檢測(cè)到12.4 g/L的乙酸(圖3 b),高濃度乙酸導(dǎo)致了菌體生長(zhǎng)被明顯抑制(圖3 b)。

? ? ??為了減少乙酸的累積,對(duì)大腸桿菌乙酸生產(chǎn)途徑基因進(jìn)行敲除,得到的菌株乙酸產(chǎn)量下降33.6%,菌體生長(zhǎng)略有改善。進(jìn)一步提升其對(duì)乙酸的耐受性,提高賴氨酸產(chǎn)率,利用MMC(微生物液滴連續(xù)傳代進(jìn)化儀)進(jìn)行適應(yīng)性進(jìn)化,在液滴體系下對(duì)超過200個(gè)液滴進(jìn)行50次傳代篩選,不斷提高乙酸濃度,得到在pH 5.1下生長(zhǎng)良好的菌株,最優(yōu)搖瓶水平產(chǎn)量為7.11 g/L(圖4)。通過在5L發(fā)酵罐中控制葡萄糖濃度與溶氧,最終L-酪氨酸產(chǎn)量達(dá)到92.8 g/L

? ? ??這一系列綜合的工程策略顯著推進(jìn)了L-酪氨酸在微生物合成中的產(chǎn)量,為工業(yè)級(jí)生產(chǎn)提供了有力的實(shí)驗(yàn)支持

3.6

圖1 葡萄糖生物合成L-酪氨酸途徑


3.6-1


圖2 敲除和過量表達(dá)基因后賴氨酸的產(chǎn)量


3.6-2



圖3 優(yōu)化菌株搖瓶與5L發(fā)酵罐發(fā)酵結(jié)果


3.6-3



圖4 大腸桿菌乙酸體系改性及耐酸性進(jìn)化




文章鏈接:https://doi.org/10.1016/j.synbio.2023.10.005?




? ? ? 本期為您推薦江南大學(xué)未來食品科學(xué)中心副主任周景文教授團(tuán)隊(duì)發(fā)表在Synthetic and Systems Biotechnology上面的一篇文章Synergetic engineering of Escherichia coli?for efficient production of L-tyrosine本研究通過協(xié)同工程策略,針對(duì)莽草酸途徑并微調(diào)代謝過程,并利用實(shí)驗(yàn)室適應(yīng)性進(jìn)化(MMC)提高菌株對(duì)酸性條件的耐受性,最終獲得了一株優(yōu)化的菌株,在5升發(fā)酵罐中62小時(shí)內(nèi)能夠產(chǎn)生92.5 g/LL-酪氨酸,對(duì)L-酪氨酸的工業(yè)化生產(chǎn)有著重要的意義。

? ? ??L-酪氨酸在食品、飼料、化工和制藥行業(yè)中具有廣泛的應(yīng)用,它不僅是多種天然產(chǎn)物的前體,如咖啡酸、類黃酮和姜黃素等,還涉及治療帕金森綜合癥的藥物L-DOPA的合成。盡管L-酪氨酸具有重要的工業(yè)價(jià)值,傳統(tǒng)化學(xué)合成或者酶促法生產(chǎn)酪氨酸的工藝存在成本高和穩(wěn)定性差的缺點(diǎn)。微生物發(fā)酵法產(chǎn)酪氨酸具有成本低,操作簡(jiǎn)單等優(yōu)勢(shì),但是也存在產(chǎn)量較低,高密度發(fā)酵菌株不夠穩(wěn)定等缺點(diǎn)。

? ? ??研究人員以大腸桿菌WSH-Z06作為起始菌株,對(duì)莽草酸和芳香氨基酸積累相關(guān)的幾個(gè)基因進(jìn)行過表達(dá)和敲除混合驗(yàn)證,得到一株聯(lián)合4個(gè)基因過表達(dá)與3個(gè)基因敲除的菌株,48 h搖瓶L-酪氨酸產(chǎn)量達(dá)到4.22 g/L(圖2 )。接著在其莽草酸途徑中添加磷酸解酮酶途徑(PK),發(fā)現(xiàn)菌株在搖瓶中的OD600提升了9.8%,但是整體的L-酪氨酸產(chǎn)量呈現(xiàn)降低趨勢(shì)。整合2個(gè)NADHNADPH互相轉(zhuǎn)化的基因后,得到的菌株產(chǎn)量提升至6.17g/L(圖3a)。將該菌株進(jìn)行5L發(fā)酵罐水平的發(fā)酵,L-酪氨酸的產(chǎn)量達(dá)到50.2 g/L,同時(shí)在發(fā)酵液中檢測(cè)到12.4 g/L的乙酸(圖3 b),高濃度乙酸導(dǎo)致了菌體生長(zhǎng)被明顯抑制(圖3 b)。

? ? ??為了減少乙酸的累積,對(duì)大腸桿菌乙酸生產(chǎn)途徑基因進(jìn)行敲除,得到的菌株乙酸產(chǎn)量下降33.6%,菌體生長(zhǎng)略有改善。進(jìn)一步提升其對(duì)乙酸的耐受性,提高賴氨酸產(chǎn)率,利用MMC(微生物液滴連續(xù)傳代進(jìn)化儀)進(jìn)行適應(yīng)性進(jìn)化,在液滴體系下對(duì)超過200個(gè)液滴進(jìn)行50次傳代篩選,不斷提高乙酸濃度,得到在pH 5.1下生長(zhǎng)良好的菌株,最優(yōu)搖瓶水平產(chǎn)量為7.11 g/L(圖4)。通過在5L發(fā)酵罐中控制葡萄糖濃度與溶氧,最終L-酪氨酸產(chǎn)量達(dá)到92.8 g/L

? ? ??這一系列綜合的工程策略顯著推進(jìn)了L-酪氨酸在微生物合成中的產(chǎn)量,為工業(yè)級(jí)生產(chǎn)提供了有力的實(shí)驗(yàn)支持

3.6

圖1 葡萄糖生物合成L-酪氨酸途徑


3.6-1


圖2 敲除和過量表達(dá)基因后賴氨酸的產(chǎn)量


3.6-2



圖3 優(yōu)化菌株搖瓶與5L發(fā)酵罐發(fā)酵結(jié)果


3.6-3



圖4 大腸桿菌乙酸體系改性及耐酸性進(jìn)化




文章鏈接:https://doi.org/10.1016/j.synbio.2023.10.005?




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